Der größte Nachteil ist meiner Meinung der überteuerte Preis. Bei Alleinlage zahlt man leider länge mal breite für die Lage. 
Weitere Nachteile sind falls man Kinder hat, dass sie komplett isoliert von den anderen Kindern sind.
Noch ein Nachteil ist Verbrecher Häuser in Alleinlage lieben. Ein Bekannter von uns hat so ein Haus und da wird regelmäßig eingebrochen bzw probiert einzubrechen.
D. h. Du brauchst zumindest 2 große Hunde und einen eingezäunten Garten für die Hunde.
Und sollte euch mal etwas passieren bzw. eurem Kind dauert es normalerweise länger bis Hilfe kommt und es wird nicht einmal wer bemerken bzw verdacht schöpfen, dass etwas passiert ist.
Bei einem shtf-szenario habt ihr als alleinstehende Haus ohne Nachbarn bzw Dorfgemeinschaft überhaupt keinen Schutz vor Plünderern oder Randalierern. Für die seid ihr ein ideales Ziel!
Vorteil von Alleinlage ist wenn man keine Leute mag, dass man natürlich keine sieht.
Ich würde zumindest ein Haus suchen, wo man wenigstens in Sichtweite eines anderen Hofes / Hauses ist. Damit zumindest ein minimum an Sicherheit da ist.